Protein–RNA interactions for Protein: B2RQT2

Vmn1r5, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r5B2RQT2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r5B2RQT2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms