Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60cB1B213 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H60cB1B213 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60cB1B213 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H60cB1B213 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H60cB1B213 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H60cB1B213 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H60cB1B213 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms