Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nipsnap3aB1AWZ3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3aB1AWZ3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms