Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2B1AVH7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms