Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scml2B1AVB3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scml2B1AVB3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms