Protein–RNA interactions for Protein: B1AUC4

Ube2u, Ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2uB1AUC4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ube2uB1AUC4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ube2uB1AUC4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ube2uB1AUC4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms