Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms