Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Grik3B1AS29 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms