Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slfn8B1ARD8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slfn8B1ARD8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms