Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprsB0V2N1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprsB0V2N1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms