Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Supt3B0QZW4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms