Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms