Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prr16A3KMN5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prr16A3KMN5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prr16A3KMN5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms