Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm6880A3KG45 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6880A3KG45 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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