Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r232A2RTT5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms