Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1jA2BFR3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms