Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl41A2AUC9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms