Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb1A2AQ07 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb1A2AQ07 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms