Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GabreA2AMW3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GabreA2AMW3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GabreA2AMW3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms