Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cavin4A2AMM0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cavin4A2AMM0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms