Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FocadA2AKG8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FocadA2AKG8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FocadA2AKG8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms