Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc183A2AJB1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc183A2AJB1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms