Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramel3A2AHA7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel3A2AHA7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms