Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm11A2AGX3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm11A2AGX3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm11A2AGX3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms