Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl2A2AGA4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms