Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef6A2A8M8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef6A2A8M8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms