Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc1lA2A5N3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc1lA2A5N3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms