Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp1bA1Z198 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms