Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LJ72

Muc16, Mucin 16, mousemouse

Predictions only

Length 8,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc16A0A140LJ72 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Muc16A0A140LJ72 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms