Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap99A0A140LIX9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cfap99A0A140LIX9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap99A0A140LIX9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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