Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43457-201ENSMUST00000200867 2409 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29423-205ENSMUST00000189006 1138 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms