Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm37459-201ENSMUST00000192259 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Fanci-202ENSMUST00000118959 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm36955-201ENSMUST00000194316 1661 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Oas1c-201ENSMUST00000117193 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm11514-201ENSMUST00000117670 432 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Snhg12-201ENSMUST00000126380 890 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Prss28-201ENSMUST00000015267 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Tpsab1-202ENSMUST00000153118 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm43225-201ENSMUST00000201381 1439 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 AC144461.2-201ENSMUST00000218219 303 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 AC140264.1-201ENSMUST00000220023 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Crx-204ENSMUST00000174318 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ccdc159-201ENSMUST00000006403 1531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gstm6-205ENSMUST00000106685 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm5394-201ENSMUST00000121935 975 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 4930455G09Rik-201ENSMUST00000126231 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm29630-201ENSMUST00000185761 359 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm9973-204ENSMUST00000221569 683 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 AC140477.2-201ENSMUST00000222037 322 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm9973-205ENSMUST00000223449 849 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm42553-201ENSMUST00000196390 1629 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Rint1-201ENSMUST00000030852 3298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm43813-201ENSMUST00000196847 2294 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Igkv3-3-201ENSMUST00000103402 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Igkv3-1-201ENSMUST00000103404 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Gm8818-201ENSMUST00000110797 1047 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Gm13402-201ENSMUST00000153600 424 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Gm13997-201ENSMUST00000155641 336 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Snca-202ENSMUST00000163779 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Igkv3-6-201ENSMUST00000196007 342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Gm33347-201ENSMUST00000200003 681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 AC161117.2-201ENSMUST00000221908 451 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Olfr1393-201ENSMUST00000078932 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Olfr73-201ENSMUST00000099838 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Nde1-202ENSMUST00000115795 2335 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Pibf1-201ENSMUST00000022650 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Hemgn-202ENSMUST00000107764 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Zfp983-201ENSMUST00000039726 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Slc5a4a-201ENSMUST00000020450 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Txnip-201ENSMUST00000049093 2795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2bQ01097 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms