Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm43480-201ENSMUST00000201201 416 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 AC107711.1-201ENSMUST00000227258 1295 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm9946-201ENSMUST00000008011 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Zscan29-202ENSMUST00000110661 5072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Zmiz2-202ENSMUST00000102914 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Arhgap12-201ENSMUST00000062584 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm37125-201ENSMUST00000195877 1559 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 1700020I14Rik-202ENSMUST00000153581 8300 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Nkiras1-202ENSMUST00000132374 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm26911-201ENSMUST00000181770 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Art2a-ps-201ENSMUST00000173420 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Nosip-207ENSMUST00000210520 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Pik3c3-203ENSMUST00000115812 3257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Epha5-203ENSMUST00000113399 5166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Pdk4-201ENSMUST00000019721 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Pfkp-207ENSMUST00000138703 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 D030018L15Rik-203ENSMUST00000140253 2902 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gsdme-203ENSMUST00000165099 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm13914-201ENSMUST00000118202 991 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm15041-201ENSMUST00000119048 756 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm12154-201ENSMUST00000145584 445 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Atp5g1-204ENSMUST00000178611 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm3534-201ENSMUST00000182522 1001 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms