Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm12271-201ENSMUST00000121719 414 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm27605-201ENSMUST00000184648 136 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 AC107711.1-201ENSMUST00000227258 1295 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm33940-201ENSMUST00000209205 1601 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Hdac7-206ENSMUST00000119670 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Pitrm1-207ENSMUST00000222485 3906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Aldob-201ENSMUST00000029987 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 Ints10-204ENSMUST00000110242 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Zfp469-202ENSMUST00000187142 3082 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 Rpa1-202ENSMUST00000092907 5077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Cnpy4-202ENSMUST00000110934 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Abcb1a-201ENSMUST00000047753 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 A930005G22Rik-201ENSMUST00000201293 1904 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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