Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Armcx5-201ENSMUST00000096321 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Pde2a-212ENSMUST00000211368 3885 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gpr85-202ENSMUST00000115491 2165 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm19611-201ENSMUST00000216401 1865 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 C6-203ENSMUST00000162350 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Pla2g5-202ENSMUST00000102511 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Rexo5-202ENSMUST00000084644 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Pcdhga7-202ENSMUST00000193476 3044 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm12830-201ENSMUST00000137570 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Uspl1-206ENSMUST00000122160 3827 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Lysmd4-204ENSMUST00000207823 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Pcdhb6-201ENSMUST00000061717 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Ano1-203ENSMUST00000121758 4552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Eif2d-203ENSMUST00000112446 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Dgki-201ENSMUST00000042075 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm45153-201ENSMUST00000205957 1901 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Nell1-202ENSMUST00000107603 2756 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm12116-201ENSMUST00000131851 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm5281-201ENSMUST00000197542 2134 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Mkl1-203ENSMUST00000131235 4222 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms