Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Scml2-202ENSMUST00000074802 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Sars-201ENSMUST00000090553 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Kif16b-203ENSMUST00000211861 4523 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Nedd4l-201ENSMUST00000080418 3326 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Top3a-203ENSMUST00000117743 2932 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm38365-201ENSMUST00000195720 2993 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 C230053D17Rik-201ENSMUST00000214451 2246 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 1700063K16Rik-202ENSMUST00000191341 952 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm3364-201ENSMUST00000196016 1217 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 1700069P05Rik-201ENSMUST00000204240 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tbccd1-201ENSMUST00000004576 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm14164-202ENSMUST00000128577 1999 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Phf21a-208ENSMUST00000111294 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Egflam-201ENSMUST00000058593 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Scnn1a-207ENSMUST00000177329 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 F630040K05Rik-201ENSMUST00000180519 2841 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Slc7a9-201ENSMUST00000032703 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Pdha2-201ENSMUST00000057860 2352 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr1221-202ENSMUST00000143255 2800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm28321-201ENSMUST00000187677 2327 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms