Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm11608-202ENSMUST00000153049 877 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Siglech-208ENSMUST00000173835 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Rsrc2-208ENSMUST00000182309 1595 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 1700010K24Rik-201ENSMUST00000125852 226 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm5561-201ENSMUST00000178932 480 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Olfr1155-201ENSMUST00000099843 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Cass4-204ENSMUST00000228775 2629 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm9260-201ENSMUST00000199781 1380 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Blnk-202ENSMUST00000117695 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm29617-201ENSMUST00000185730 610 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 AC157931.1-201ENSMUST00000198565 346 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 CT025603.2-201ENSMUST00000224369 484 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 AC161763.1-201ENSMUST00000227063 168 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Opn1mw-201ENSMUST00000033771 1227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 n-R5s5-201ENSMUST00000083134 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Mgst2-201ENSMUST00000099106 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm5092-201ENSMUST00000188185 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms