Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Lysmd4-204ENSMUST00000207823 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Plcd4-202ENSMUST00000067916 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gdi2-201ENSMUST00000059515 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Bcl2l14-202ENSMUST00000111960 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm37125-201ENSMUST00000195877 1559 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Bcas3-206ENSMUST00000108062 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Fkbp5-202ENSMUST00000114792 3858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Pnpla1-202ENSMUST00000114737 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Pnpla1-201ENSMUST00000056866 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Rhbdd1-201ENSMUST00000027322 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 C1ra-201ENSMUST00000068593 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Brd9-201ENSMUST00000099384 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Arhgap12-201ENSMUST00000062584 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Cnbd2-203ENSMUST00000109580 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 A230056P14Rik-201ENSMUST00000130189 2177 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm17816-201ENSMUST00000219991 2603 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Chid1-201ENSMUST00000026586 3964 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Ppp6c-201ENSMUST00000028087 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Klf8-201ENSMUST00000039545 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Creb5-201ENSMUST00000047450 2330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Klk1b4-201ENSMUST00000077354 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Olfr156-201ENSMUST00000079234 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Tubd1-205ENSMUST00000167178 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 1300002E11Rik-201ENSMUST00000180830 3557 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Arhgap10-203ENSMUST00000210922 2208 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Cd28P31041 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Cd28P31041 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Cd28P31041 Eapp-204ENSMUST00000161592 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Trim13-202ENSMUST00000165015 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Cdh1-201ENSMUST00000000312 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Osbpl9-218ENSMUST00000162787 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Gm17249-201ENSMUST00000181277 3500 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Gm43135-201ENSMUST00000196442 3462 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Cntln-203ENSMUST00000107190 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Snrpd3-201ENSMUST00000020397 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Cd28P31041 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
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