Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm42735-201ENSMUST00000201718 1646 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Kcnh6-201ENSMUST00000001965 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Mepe-201ENSMUST00000066207 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Mgat4a-202ENSMUST00000143636 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Zfp287-203ENSMUST00000128370 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm15894-201ENSMUST00000162828 2067 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm43813-201ENSMUST00000196847 2294 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Cdc25b-201ENSMUST00000028804 3089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Fbxo34-204ENSMUST00000165714 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 5430416N02Rik-201ENSMUST00000180779 3486 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm44070-201ENSMUST00000203389 2220 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou4f1P17208 Gm14164-202ENSMUST00000128577 1999 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms