Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm28309-201ENSMUST00000136302 623 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm13629-201ENSMUST00000141149 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 2410141K09Rik-204ENSMUST00000173583 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm4398-201ENSMUST00000182698 992 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Cyp2e1-203ENSMUST00000210235 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 1110017D15Rik-202ENSMUST00000095126 884 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Tmem254c-201ENSMUST00000100818 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm8955-201ENSMUST00000182945 1008 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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