Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Fam110c-201ENSMUST00000041133 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Gm4926-201ENSMUST00000132691 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Apex2-203ENSMUST00000112720 4742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Cdc25b-201ENSMUST00000028804 3089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Dtnbos-201ENSMUST00000173847 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rcbtb2-201ENSMUST00000022702 2971 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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