Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 5430437J10Rik-202ENSMUST00000227355 634 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Btnl6-201ENSMUST00000075483 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 2410002F23Rik-202ENSMUST00000071296 4201 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm37052-201ENSMUST00000194929 1831 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Bcl2l14-202ENSMUST00000111960 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Cbx3-203ENSMUST00000114445 1585 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc14b-201ENSMUST00000022064 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Tdrd1-203ENSMUST00000111606 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Atg14-201ENSMUST00000042988 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Asb3-201ENSMUST00000020551 3228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm5114-201ENSMUST00000108017 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Tcp10b-201ENSMUST00000086787 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Trim13-202ENSMUST00000165015 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Rps19-ps3-201ENSMUST00000116174 426 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 C1ra-201ENSMUST00000068593 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Kidins220-202ENSMUST00000220459 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Nuggc-202ENSMUST00000150897 2745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Adgrl3-219ENSMUST00000122356 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Lonp2-203ENSMUST00000122188 2372 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Smim1-202ENSMUST00000126119 3996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm26704-201ENSMUST00000181362 2901 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Nrp2-201ENSMUST00000027112 4216 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Exosc1-201ENSMUST00000075280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Trpc5-201ENSMUST00000040184 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rexo5-202ENSMUST00000084644 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Sms-201ENSMUST00000112529 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm1821-201ENSMUST00000111388 685 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Bco2-201ENSMUST00000119103 2118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm2071-201ENSMUST00000193335 774 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms