Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Sfi1-203ENSMUST00000101655 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Htr1a-201ENSMUST00000022235 4484 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms