Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 4930543E12Rik-202ENSMUST00000210408 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl3-201ENSMUST00000001008 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Lyrm1-207ENSMUST00000208202 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11149-202ENSMUST00000215070 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr721-ps1-201ENSMUST00000165291 975 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms