Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Homer1-204ENSMUST00000102752 5713 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 Arhgap45-203ENSMUST00000105373 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Pla2g5-202ENSMUST00000102511 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 Elmo1-201ENSMUST00000072519 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 Arhgap10-203ENSMUST00000210922 2208 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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Ccl20O89093 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Ccl20O89093 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
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Ccl20O89093 Gm15041-201ENSMUST00000119048 756 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccl20O89093 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccl20O89093 Gm12826-201ENSMUST00000121841 379 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccl20O89093 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
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Ccl20O89093 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccl20O89093 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccl20O89093 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccl20O89093 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccl20O89093 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccl20O89093 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
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