Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm12645-201ENSMUST00000117297 275 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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