Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms