Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Homer1Q9Z2Y3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms