Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac5Q9Z2V6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hdac5Q9Z2V6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms