Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gipc2Q9Z2H7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gipc2Q9Z2H7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms